Костанайская область обладает достаточной большой территорией с разными природными зонами, имеется степь, ленточные боры, околковые леса, реки, большое количество озер, небольшая холмистость. Среди видового разнообразия флоры и фауны имеются редкие виды требующие особой охраны. Они внесены в Красную книгу Костанайской области, в которую входят такие представители животного мира как: ласка, горностай, куница, выхухоль.кудрявый и розовый пеликаны, лебедь кликун, савка, колпица, серый журавль, журавль-красавка, орлан-белохвост, беркут, орел-могильник, степной орел, балобан, дрофа, стрепет, кречетка, саджа, филин, черноголовый хохотун, малый лебедь, краснозобая казарка, белоглазая чернеть, черный турпан, стерх, скопа, сапсан, тонкоклювый кроншнеп, малая белая цапля, желтая цапля, каравайка, чернобрюхий рябок, орлан-долгохвост, змееяд.
Из видового состава растений в Красную книгу Костанайской области внесены растения эндемики - берёза киргизская, астрагал Нины, астрагал Кустанайский, тимьян казахстанский, льнянка длинноплодная, а также 5 видов реликтовых: тонконог жестколистый, ковыль перистый, чип блестящий, кувшинка белая, селитрянка Шобера. В Красную книгу Казахстана входит 5 видов произрастающих на территории области: берёза киргизская, росянка круглолистная, наголоваткамугоджарская, тюльпан Шренка, тонконог жестколистый. Всего особой охраны требуют 125 видов или 18 % флоры..