Политика зубатовщины была направлена на создание легальных профессиональных союзов, которые должны были направить рабочее движение на путь мирной защиты экономических интересов трудящихся. На собраниях зубатовских организаций читались общеобразовательные лекции, велись беседы о нравственности. Особое внимание уделялось легальным формам экономической борьбы, касавшимся улучшения материального положения рабочего класса. Зубатов провел реформу системы политического сыска. По его инициативе во всех крупных городах империи создавались охранные отделения, подчинённые непосредственно Департаменту полиции. В их руках должно было сосредоточиться всё дело политического розыска, до ареста революционеров включительно. Зубатов поддержал популярного среди рабочих священника Георгия Гапона в создании новой рабочей организации - «Собрания русских фабрично-заводских рабочих г. Санкт-Петербурга».