28 августа 1941 года был издан Указ Президиума Верховного Совета СССР «О переселении немцев, проживающих в районе Поволжья». Немцам было отдано распоряжение в течение 24 часов подготовиться к переселению и с ограниченным количеством своего имущества прибыть в пункты сбора. Большая часть выселенных немцев направлялась в сельскохозяйственные районы. Высококвалифицированные рабочие, инженеры, учителя оставались в городах и районных центрах (их было незначительное количество). Отдельное жильё переселённым немцам не предоставлялось, в большинстве случаев их подселяли к местным жителям, что приводило к существенным неудобствам и конфликтам. В ходе депортации немцы лишились своего имущества и средств к существованию, многие погибли, не выдержав тяжёлых условий переезда. Всего по данным НКВД в сентябре-октябре было выселено 438 6 тысяч немцев. В последующие месяцы депортация продолжилась, и всего в годы войны было депортировано до 950 тысяч немцев. 367 тысяч немцев было депортировано на Восток: Коми, Урал, Сибирь, Алтай.
До 1956 года подавляющее большинство немцев в местах своего проживания находились на спецпоселении и вынуждены были ежемесячно отмечаться в комендатуре. В результате депортации произошло коренное изменение положение немецкого населения в СССР. Кардинально изменилась география расселения немцев, многие погибли. Произошло распыление немцев на огромной территории, в результате чего происходило быстрое развитие ассимиляционных процессов.