С самого начала Великой Отечественной войны церковь заняла патриотическую позицию и благословила «всех православных на защиту священных границ Родины». Московская патриархия публично осудила тех, кто шёл на сотрудничество с оккупантами. В 1943 г. Сталин разрешил выборы патриарха, которого у Русской
Православной Церкви не было со дня смерти Тихона в 1925 г. Собор епископов избрал патриархом Московским и Всея Руси митрополита Московского и Коломенского Сергия.