При массовом отборе происходит выделение группы организмов с необходимыми признаками с целью получения от них потомства, а при индивидуальном – только одной особи. Массовый отбор эффективен в селекции перекрестно-опыляемых растений, индивидуальный – в селекции самоопыляющихся растений. Но оба отбора подходят для селекции животных.
При массовом отборе всегда необходимо повторение процедуры. Индивидуальный может быть как однократным, так и повторным. Результат массового отбора – генетически разнообразный материал. Индивидуальный отбор практически всегда приводит к получению генетически однородных организмов (чистых линий).