У высших организмов, по сравнению с прокариотами, в генах отсутствует оператор, а каждый их ген кроме кодирующей области имеет еще и некодирующие регуляторные участки, находящиеся как перед геном, так и после него, и даже внутри него. С ними способны взаимодействовать многочисленные регуляторные белки – факторы транскрипции. Они могут активировать и подавлять процесс транскрипции.
Также большинство генов эукариот состоит из экзонов. В них записана информация, как о последовательности аминокислот, так и об интронах – чередующихся с ними некодирующих участках.