Марфа выступила против политики московского князя, потому что не хотела, чтобы Новгород вошел в состав Московского княжества. В планы новгородской аристократии входили создание в Новгороде православного наместничества, зависимого от Литовского государства, а также брак будущего наместника из числа литовских панов с самой богатой новгородской собственницей - Марфой Борецкой.