Биологическую продуктивность Азовского моря частично можно восстановить путем снижения сбросов загрязненных сточных вод от промышленных предприятий. Также перестройка гидроэлектростанций на Дону и Кубани в гидроаккумулирующие, чтобы увеличить сток пресных вод в море. Важным этапом в увеличении биологической продуктивности может быть очистка акватории от мусора и нефтепродуктов.