Да, позвоночные имеют более высокую организацию, чем бесчерепные. По сравнению с бесчерепными у позвоночных более совершенные системы внутренних органов, нервная трубка разделяется на головной и спинной мозг, появляется позвоночник, череп, парные конечности и их пояса, усложняется строение органов чувств (усложняется поведение).