У хрящевых рыб появляется двухкамерное сердце, состоящее из предсердия и желудочка. Хорошо развит головной мозг, он состоит из пяти отделов: передний промежуточный, средний, мозжечок, продолговатый. У хрящевых рыб развиваются специализированные мышцы, управляющие движением парных плавников. Оплодотворение внутреннее. Они размножаются, откладывая яйца; для некоторых видов хрящевых рыб характерно живорождение.