Молекулы ДНК, входящие в состав сестринских хроматид одной хромосомы, идентичны (имеют одинаковую последовательность нуклеотидов), потому что они образуются в результате репликации исходной материнской молекулы ДНК. В каждой из двух молекул ДНК, которые входят в состав сестринских хроматид, содержится одна цепь исходной материнской молекулы ДНК (матрица) и одна новая дочерняя цепь, синтезированная на этой матрице.
Молекулы ДНК, входящие в состав гомологичных хромосом, неодинаковы. Это связано с тем, что гомологичные хромосомы имеют разное происхождение. В каждой паре гомологичных хромосом одна является материнской (унаследована от матери), а другая – отцовской (унаследована от отца).