Благодаря Красной книге сохранились:
копытные - джейран, туркменский кулан, архар; устюртский, алтайский, каратауский муфлоны; тугайный олень;
хищные - снежный барс, тянь-шаньский бурый медведь, барханный кот, каракал, манул, медоед;
грызуны - бобр, сурок Мензбира, селевиния, пятипалый и трехпалый карликовые тушканчики;
насекомоядные - выхухоль, длинноиглый еж;
водоплавающие - кудрявый и розовый пеликаны, лебедь-кликун, фламинго, белый и черный аисты;
обитатели степей и пустынь - дрофа, джек, кречетка, журавль-красавка; хищные птицы - бородач, кумай, беркут, могильник, орлан-белохвост, соколы - сапсан и балобан;
пресмыкающиеся - варан, желтопузик, пестрая круглоголовка, глазчатая ящурка, 4 вида полозов, земноводные - семиреченский тритон;
рыбы - аральский и каспийский лососи, сырдарынский лжелопатонос и лысач (щуковидный жерех).
Красной книге сохраняются такие редкие растения как:
Болотник Верещагина - редкий, эндемичный вид
Лук дернистый - редчайший, узкоэндемичный, находится под угрозой исчезновения
Ирис Людвига - редкий, узкоэдемичный
Гимноспермиум алтайский - редкий вид, во многих местах исчезающий
Строгановиястрелолистая - очень редкий, эндемичный реликтовый вид
Родиоларозовая - ценный вид - ценный вид, с сильно сокращающейся численностью