Существует множество методик деления рефлексов на группы. Так, по местонахождению нервного центра все рефлексы можно подразделить на спинномозговые и рефлексы головного мозга.
В зависимости от рецептора, который запускает рефлекс, их можно разделить на зрительные, слуховые, вкусовые, обонятельные, кожные и т. д.
По системам органов рефлексы можно делить на пищевые (выделение слюны и желудочного сока, глотание и др.), дыхательные (вдох, кашель, чихание), двигательные (коленный, отдергивание руки от горячего предмета), сердечно-сосудистые (сужение и расширение сосудов, учащение сердцебиения) и т. д. Но самым важным является деление рефлексов на условные и безусловные.