Несмотря на междоусобицы, период раздробленности не стал временем упадка страны. Необходимость содержать большие отряды самураев побуждала князей заботиться о росте доходов. С этой целью они поощряли использование новых культур и приёмов земледелия, следили за системой орошения. В результате крестьяне получали не один, а два или даже три урожая риса в год. Также распространилось Выращивание хлопчатника. Князья стимулировали развитие торговли, ремесла и горного дела на своих землях, что дало импульс к росту городов, где сложились союзы ремесленников и торговцев.
Крестьянские общины также имели самоуправление и при случае могли за себя постоять, тем более что многие крестьяне имели оружие. Нередко они поднимали восстания, стремясь избавиться от несения повинностей. К крестьянам присоединялись разорившиеся или потерявшие господина самурай, городская беднота и буддийские монахи. В одной провинции восставшие даже захватили власть и создали государство, просуществовавшее около ста лет.