В начале 1990-х гг. возникла необходимость выработать новые принципы федеративного строительства в нашей стране, так как произошло усиление национальных движении и сепаратистских настроений. Перед Россией встала задача сохранения своей территориальной целостности.
В канун президентских выборов 1991 г. Б.Н. Ельцин призвал региональных руководителей брать как можно больше самостоятельности и заключить Федеративный договор с Центром. Федеративный договор был подписан 31 марта 1992 г. представителями всех республик, краёв и областей в составе РСФСР, кроме Татарстана и Чечни.
Конституция 1993 г. провозгласила Россию федеративным государством и закрепила основные принципы федеративного устройства страны: государственную целостность России, единство системы государственной власти, разграничение полномочий между федеральными органами власти и органами субъектов Федерации, равноправие и право на самоопределение проживающих в ней народов
Однако Федеративный договор и Конституция не устранили всех противоречий. Сохранялось неравенство субъектов. Принятые в некоторых республиках государственные акты не только противоречили Конституции и федеральным законам, но и нарушали принципы федеративного устройства России. Края и области, обладавшие мощным экономическим потенциалом и многочисленным населением, энергично протестовали против неравенства субъектов Федерации. Встал вопрос и о гарантиях прав русских, проживающих в национальных регионах. В Татарстане и Чечне преобладали сепаратистские настроения. Президенту Татарстана М.Ш. Шаймиеву удаюсь взять ситуацию под контроль оговорив особый статус Татарстана в составе Российской Федерации. В феврале 1994 года Татарстан подписал на этих условиях с федеральными властями договор о разграничении полномочий. Чечня отказалась от заключения любых договоренностей с Центром, что привело к попытке силового решения данной проблемы (1-я Чеченская война 1994-1996 гг.).
Главными результатами национальной политики в эти годы стало воссоздание Российской Федерации, сохранение ее целостности, утверждение принципов федеративного устройства страны. Отношения Центра и регионов приобрели более равноправный характер. Однако преодолеть многие противоречия и решить все проблемы на этом этапе было невозможно. Роль федерального центра в отношениях с регионами была ослаблена. Произошло оживление русского национального движения, лидеры которого выражали недовольство невниманием власти к проблемам русских. Нерешенным оставался вопрос о будущем Чечни. Задача сохранения территориальной целостности России по-прежнему являлась одной из самых острых.