1999 год знаменовался крупными терактами в России. В ответ на вытеснение сепаратистов с территории Дагестана боевики взорвали жилые дома в Буйнакске, Москве и Волгодонске, в результате которых погибли сотни невинных людей. В связи с этим одним из основных направлений стала борьба с терроризмом. Осенью 1999 года федеральные войска вошли в Чечню и в короткий срок взяли под контроль важнейшие населённые пункты.
Наряду с боевыми операциями развернулась работа по налаживанию мирной жизни. Были сформированы новые органы управления, открыты представительства федеральных органов власти, созданы отряды местной милиции.
Федеральная власть сделала ставку в урегулировании военно-политического кризиса в Чечне на делание чеченского народа к восстановлению мира на Кавказе и опиралась на самих чеченских лидеров. На референдуме 2003 г. жители Чечни высказались за сохранение республики в составе Российской Федерации, приняли Конституцию Чеченской Республики.