Недостатки воздушного транспорта: слишком высокая стоимость перевозки, ограниченная грузоподъёмность; невозможность перевозки широкой номенклатуры грузов; зависимость от климатических условий и наземной инфраструктуры.
Трубопроводы являются важнейшей частью транспортной системы. Трубопроводный транспорт имеет определенные недостатки высокая стоимость начальных капиталовложений при строительстве нефтегазопроводной сети, опасность нанесения ущерба экологии (особенно при транспортировании подводных трубопроводов), сложность прокладки трассы в определенных районах.