В отличие ото мхов, папоротники обладают более сложной структурой и морфологией. Например, у них развиты настоящие листья, которые отличаются и структурой, и узорами. Листья папоротников имеют разветвленную форму, что позволяет им обеспечивать большую поверхность для газообмена и фотосинтеза.
К усложнениям строения можно отнести наличие у папоротников настоящей сосудистой системы. При помощи сосудов в них осуществляется транспорт воды и питательных веществ, полученных в результате фотосинтеза, от листьев к другим частям растения.
Также у папоротников, в отличие ото мхов, происходит чередование поколений – гаметофитов и спорофитов. Споры у них формируются в специальных структурах – спорангиях, которые находятся на нижней стороне листьев.