Двоякодышащие рыбы имеют костяной головной скелет, состоящий из множества костей. У них две пары жаберных крышек, которые защищают жабры от повреждений. Они также обладают плавательным пузырем, который помогает им регулировать плавучесть и двигаться в воде. Их скелет состоит из костей, что обеспечивает опору и защиту внутренних органов. У двоякодышащих рыб есть две жабры на каждой стороне, общее количество жабр равно четырем. Они обычно имеют чешую, которая защищает тело и уменьшает трение в воде.
Кистеперые рыбы, в отличие от двоякодышащих, имеют гибкий хрящевый головной скелет, без костей. У них есть одна пара жаберных крышек, которые защищают жабры от повреждений. Кистеперые рыбы не имеют плавательного пузыря, поэтому используют другие способы регулировать плавучесть. Их скелет состоит из хрящевой ткани, что придает им гибкость и маневренность, но не так хорошо защищает органы. У кистеперых рыб есть одна жабра на каждой стороне, общее количество жабр равно двум. Некоторые кистеперые рыбы могут не иметь чешуи и могут иметь голое или покрытое слизью тело, что помогает им передвигаться в воде.