Бактерии играют огромную роль в природе и в жизни человека. Полезные бактерии участвуют в процессе обмена веществ человека, служат для изготовления разнообразных продуктов питания (кисломолочные бактерии), помогают заниматься сельскохозяйственной деятельностью (азотофиксирующие бактерии и прочие).
Вредные бактерии при попадании в организм человека могут привести к болезням или даже к смерти. Из-за этого, во времена когда человек ещё не научился защищаться от деятельности вредных бактерий, во время эпидемий умирали сотни и тысячи людей. Бактерии буквально опустошали города и страны.
В природе бактерии являются важным учасником большого круговорота веществ. Они расщепляют сложные органические вещества, попадающие в почву вместе с отмершими грибами, растениями и животными, до простых минеральных и органических веществ, пригодных для впитывания растениями.