Ванилин имеет кристаллическую решетку типа моноклинной системы. В моноклинной системе оси кристаллической решетки расположены под углом друг к другу, и одна из осей имеет отличную от других осей длину. Такая структура обуславливает форму кристаллов ванилина и их физические свойства.