Кукушкин леи - это довольно крупный мох, размеры могут достигать 15-20 сантиметров.
Он не имеет настоящих корней, как высшие растения. Вместо корня у кукушкина льна имеются ризоиды, удерживающие его на субстрате (почве) и выполняющие функцию впитывания влаги. Стебель у кукушкиного льна прямой, не ветвящийся, и покрыт множеством листочков, которые имеют центральное ребро. Кукушкин лен размножается спорами, образуя коробочки со спорами - спорангии,