Плоские черви обладают двусторонней симметрией, а кишечнополостные имеют радиальную симметрию. У плоских червей отчётливо выделены передний и задний концы. У плоских червей появляется третий зародышевый листок - мезодерма, расположенная между эктодермой и энтодермой. Кишечнополостные - двухслойные животные, а плоские черви трехслойные. У плоских червей впервые возникает выделительная система. Нервная система лестничного типа (у кишечнополостных диффузная нервная система)