Некоторые виды двукрылых являются кровососами и паразитами домашних животных, переносчиками опасных заболеваний. Малярийный комар переносит возбудителя малярии -малярийного плазмодия. Москиты являются переносчиками лейшманий. Муха цеце распространяет возбудителя сонной болезни. На лапках и в брюшной полости одна комнатная муха может переносить до нескольких миллионов микроорганизмов, среди которых могут быть возбудители брюшного тифа, дизентерии, туляремии, холеры, сибирской язвы, туберкулёза. Также мухи могут переносить яйца паразитических червей.