В скелете млекопитающих, как и пресмыкающихся, выделяют череп, позвоночник, грудную клетку, конечности и их пояса Позвонки млекопитающих плоские, плотно соединены друг с другом с помощью хрящевых межпозвоночных дисков - менисков. Череп млекопитающего отличается выраженным мозговым отделом. Зубы у млекопитающих специализированные, в отличие от зубов пресмыкающихся. В шейном отделе млекопитающих 7 позвонков. В переднем поясе конечностей млекопитающих нет коракоидов, что связано с тем, что передние конечности расположены под телом, а не по бокам от него, как у пресмыкающихся, и двигаются только вдоль длинной оси тела. Ключицы есть у млекопитающих, совершающих многообразные и сложные движения (обезьяны, кроты, рукокрылые), у остальных млекопитающих ключиц нет. Скелет конечностей схож со скелетом конечностей пресмыкающихся и представлен двумя парами конечностей.