Кордильеры сформировались в два главных этапа горообразования на протяжении мезозоя - начала кайнозоя. К более древней, невадийской складчатости (горы Сьерра-Невада в западной полосе Кордильер) относится западная и центральная зона горной системы; в более позднюю ларамийскую складчатость (горы Ларами в составе Южных Кордильер) образовались Скалистые горы.