В канун президентских выборов 1991 г. Б.Н. Ельцин призвал региональных руководителей брать как можно больше самостоятельности и заключить Федеративный договор с Центром. Проект договора содержал положение о том, что Россия становится федерацией независимых национальных государств, в которых преимущественными правами на землю, недра, производственные мощности пользуется народ данного государства. Родному языку предоставлялся статус государственного.
Федеративный договор был подписан 31 марта 1992 г. представителями всех республик, краёв и областей в составе РСФСР, кроме Татарстана и Чечни. Конституция 1993 г. провозгласила Россию федеративным государством и закрепила основные принципы федеративного устройства страны: государственную целостность России, единство системы государственной власти, разграничение полномочии между федеральными органами власти и органами субъектов Федерации, равноправие и право на самоопределение проживающих в ней народов.
В 1990-е гг. удалось укрепить Российскую Федерацию, сохранить её целостность, утвердить новые принципы федеративного устройства страны. Отношения Центра и регионов приобрели более равноправный характер. Однако многие противоречия не были решены.