В отличие от птиц, ротовое отверстие млекопитающих окружено мягкими губами, которые играют важную роль при сосании молока. У млекопитающих в отличие от птиц есть зубы. У некоторых видов птиц длинный пищевод образует расширение - зоб; у млекопитающих зоба нет, Желудок птиц состоит из двух отделов - железистого и мускульного. У птиц желчный пузырь может отсутствовать. У птиц на границе тонкого кишечника и прямой, кишки находятся парные выросты — слепые кишки. У млекопитающих, питающихся грубым растительным кормом, на границе тонкого и толстого кишечника отходит длинная и широкая слепая кишка. У некоторых зверей она заканчивается червеобразным отростком.
Непереваренные остатки пищи у млекопитающих Удаляются через анальное отверстие (только у низших млекопитающих есть клоака), а у птиц через клоаку. Короткая пищеварительная система у птиц является приспособлением к полету (облегчение массы тела птицы)