Обострение конфликта между Б.Н. Ельциным и Верховным Советом, а также большинством депутатов Съезда народных депутатом произошло из-за распада СССР и проведения «шоковой терапии». Президент и Верховный Совет не могли найти компромисс в вопросе об основах политического строя. Президент выступал за создание президентской республики. Верховный Совет предлагал сохранить традиционное для советской политической системы положение о «полновластии» Советов как источника всей - законодательной, исполнительной и судебной - власти.
Напряженная борьба между Президентом и Верховным Советом по поводу конституционной реформы продолжалась весь 1992 год и первые девять месяцев 1993 г. Противостояние зашло в тупик: ни Президент, ни Верховный Совет не соглашались на компромисс. Попытка разрешить это противостояние в ходе референдума в апреле 1993 г. оказалась неудачной. К осени ситуация стала неразрешимой. Преодолеть кризис, не меняя действующую Конституцию, было невозможно.
21 сентября 1993 года Б.Н. Ельцин издал указ № 1400 о поэтапной конституционной реформе. Он приостановил полномочия Съезда народных депутатов и Верховного Совета РСФСР и назначил на 12 декабря 1993 года выборы в Государственную Думу.
Конституционный суд признал указ не соответствующим Конституции РСФСР.
Руководство Верховного Совета во главе с председателем Р.И. Хасбулатовым этому указу не подчинилось и приняло постановление о прекращении полномочий президента Ельцина. Верховный Совет приступил к формированию подконтрольных ему органов исполнительной власти. Исполняющим обязанности главы государства был объявлен вице-президент А.В. Руцкой.
Ельцин приказал войска окружить здание Верховного Совета, а депутатам = покинуть его. С 1 октября при посредничестве патриарха Алексия II проводились переговоры сторон, на которых предлагалось принять «нулевой вариант» - одновременное проведение выборов Президента и депутатов. Переговоры оказались безрезультатными.
Противостояние Президента и Верховного Совета в вопросе об основах политического строя привело к вооруженному столкновению 2-3 октября 1993 гола и обстрелу Белого дома. Для восстановления порядка Президент объявил в столице чрезвычайное положение, были введены войска и бронетехника. 4 октября здание Верховного Совета начали обстреливать из танков. К концу дня Белый дом был занят войсками, а руководители сопротивления были арестованы.
В результате данных событий Съезд народных депутатов и Верховный Совет были ликвидированы. До избрания Федерального Собрания и принятия новой Конституции в РФ устанавливалось прямое президентское правление.